Mesencephalon er en nær relation bagtil. Den er vist med gult.

Foramen interventriculare findes på et tidligt tidspunkt i neuralrørets udvikling. Det kan identificeres, når der er dannet 5 sekundære hjerneblærer. De gule pile viser foramen interventriculare i neuralrøret mellem den vordende tredje ventrikel og den endnu meget beskedne lateralventrikel (L).

Tegningen til højre viser snitretningen for et frontalsnit gennem foramen interventriculare, angivet ved den lige linie. Resultatet af snittet ses til venstre, hvor man har ramt tredje ventrikel og foramen interventriculare, der passeres af de farvede pile samt lateralventriklerne, hvor pilespidserne ligger.

I lateralvæggen af tredje ventrikel er der i hver side en åbning. Den forbinder tredje ventrikel med lateralventriklen. Åbningen er spalteformet og ligger foran thalamus. Dens navn er foramen interventriculare. Den røde pil strækker sig fra tredje ventrikel og til lateralventriklen, hvor pilehovedet findes. Lateralventriklen er skåret igennem på tværs ved pilen.

Forvæggen, der er lyseblå, dannes af endepladen lamina terminalis. Den svarer til neuralrørets forreste ende, som vist på den lille tegning øverst til venstre.

Loftet dannes af tela choroidea, der er farvet rødt.

I bagvæggen findes indmundingen af aqueductus mesencephali ved den gule pil samt tilhæftningen af corpus pineale ved de røde pile. Selve corpus pineale, koglekirtlen, er markeret (C). Det er den vigtigste del af epithalamus.

Bunden dannes af den nederste del af hypothalamus, der er tegnet gul.

Lateralvæggen i tredje ventrikel dannes af thalamus og lidt af hypothalamus.

Metathalamus ligger bag thalamus, lateralt for hjernestammen. De to små knuder, der her er tegnet røde. De ligger lateralt for firhøjene (F) nær crus cerebri (C) og under og bag thalamus (T).